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08_oacct_sherpa_issns.py
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Sat, Nov 2, 13:16

08_oacct_sherpa_issns.py
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#!/usr/bin/env python
# coding: utf-8
# # Projet Open Access Compliance Check Tool (OACCT)
#
# Projet P5 de la bibliothèque de l'EPFL en collaboration avec les bibliothèques des Universités de Genève, Lausanne et Berne : https://www.swissuniversities.ch/themen/digitalisierung/p-5-wissenschaftliche-information/projekte/swiss-mooc-service-1-1-1-1
#
# Ce notebook permet d'extraire les données choisis parmis les sources obtenues par API et les traiter pour les rendre exploitables dans l'application OACCT.
#
# Auteur : **Pablo Iriarte**, Université de Genève (pablo.iriarte@unige.ch)
# Date de dernière mise à jour : 16.07.2021
# ## Table ISSNs
# In[1]:
import pandas as pd
import csv
import json
import numpy as np
# In[2]:
issns = pd.read_csv('sample/issn_brut.tsv', encoding='utf-8', sep='\t')
issns
# ## Ajout du format à partir de Sherpa
# In[3]:
# ajout du format par sherpa
issn_sherpa = pd.read_csv('sample/issn_sherpa.tsv', encoding='utf-8', sep='\t')
issn_sherpa
# In[4]:
issn_sherpa['type'] = issn_sherpa['type'].str.upper()
issn_sherpa
# In[5]:
issns = pd.merge(issns, issn_sherpa[['issn', 'type']], on='issn', how='outer')
issns
# In[6]:
issns['format'].value_counts()
# In[7]:
issns['type'].value_counts()
# In[8]:
# tester les lignes sans type
issns.loc[issns['format'].isnull()].loc[issns['type'].isnull()]
# In[9]:
# tester les lignes avec type égal
issns.loc[issns['format'] == issns['type']]
# In[10]:
# tester les lignes avec type diff
issns.loc[issns['format'] != issns['type']]
# In[11]:
# attribution de l'id du type avec préference par ISSN.org puis Sherpa
# PRINT = 1
# ELECTRONIC = 2
# OTHER = 3
issns['issn_type'] = issns['format']
issns.loc[issns['format'].isna(), 'issn_type'] = issns['type']
issns['issn_type'] = issns['issn_type'].str.replace('PRINT', '1')
issns['issn_type'] = issns['issn_type'].str.replace('ELECTRONIC', '2')
issns['issn_type'] = issns['issn_type'].str.replace('OTHER', '3')
issns['issn_type'] = issns['issn_type'].fillna(3)
issns
# In[12]:
# test de diffs
issns.loc[issns['format'] == 'PRINT'].loc[issns['type'] == 'ELECTRONIC']
# In[13]:
# test de diffs
issns.loc[issns['format'] == 'ELECTRONIC'].loc[issns['type'] == 'PRINT']
# In[14]:
# test de diffs
issns.loc[issns['format'].isna()].loc[issns['type'] == 'PRINT']
# In[15]:
# convertir journal en int
issns['journal'] = issns['journal'].astype(int)
# In[16]:
# convertir l'index en id
issns = issns.reset_index()
issns['id'] = issns['index'] + 1
del issns['index']
issns
# In[17]:
issns['issn_type'] = issns['issn_type'].astype(int)
# In[18]:
issns_export = issns[['id', 'issn', 'journal', 'issn_type']]
issns_export
# In[19]:
# supprimer les doublons par ISSN
issns_export = issns_export.drop_duplicates(subset='issn')
issns_export
# In[20]:
# esport JSON
result = issns_export.to_json(orient='records', force_ascii=False)
parsed = json.loads(result)
with open('sample/issn.json', 'w', encoding='utf-8') as file:
json.dump(parsed, file, indent=2, ensure_ascii=False)
# In[21]:
# export csv
issns_export.to_csv('sample/issn.tsv', sep='\t', encoding='utf-8', index=False)
# In[22]:
# export excel
issns_export.to_excel('sample/issn.xlsx', index=False)

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