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6303826d2969efficient_neuronet

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fluid_structure_interaction.lmp
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# combined TLSPH / ULSPH example
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# A column of water is placed in a container and allowed to collapse unter the
# influence of gravity. Several solid objects are also placed in the container.
# The water flow pushes the solid objects around until the sytem comes to halt due to
# viscous damping. The solid objects have a lower mass density than water and finally float on
# the water surface.
#
# Water is modelled using the Updated Lagrangian formalism. Solid bodies are modelled using the
# Total Lagrangian formalism. Contact forces between container, solid bodies, and water prevent
# mutual penetration of these physical entities.
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# unit sytem: GPa / mm / ms
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# MATERIAL PARAMETERS
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variable rho_water equal 1000 # mass density water
variable rho_obj equal 300 # mass density solid objects
variable c0 equal 10.0 # speed of sound for water
variable E equal 5*${c0}*${c0}*${rho_water} # Young's modulus for solid objects
variable nu equal 0.3 # Poisson ratio for solid objects
variable sigma_yield equal 0.1*${E} # plastic yield stress for solid objects
variable hardening_parameter equal 0 # plastic hardening parameter for solid objects
variable contact_stiffness equal 2.5*${c0}^2*${rho_water} # contact force amplitude
variable q1 equal 1.0 # artificial viscosity
variable q2 equal 0.0 # artificial viscosity
variable Hg equal 10 # Hourglass control coefficient for solid objects
variable Cp equal 1.0 # heat capacity -- not used here
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# INITIALIZE LAMMPS
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units si
dimension 2
boundary sm sm p
atom_style smd
neigh_modify every 5 delay 0 check yes
comm_modify vel yes
newton off
atom_modify map array
comm_style tiled
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# CREATE INITIAL GEOMETRY
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# create simulation box, a container, and a water column
variable l0 equal 0.05 # initial particle lattice spacing
region box block 0 6 0 8 -0.01 0.01 units box
create_box 3 box
region water block 0.25 1 0.25 4 EDGE EDGE units box
region container block 0.15 5.85 0.15 8 -0.01 0.01 units box side out # container
lattice sq ${l0}
create_atoms 1 region water
group water type 1
create_atoms 3 region container
group container type 3
# create some solid objects to be pushed around
region obj1 prism 2 2.6 0.25 0.85 EDGE EDGE 0.3 0 0 units box
region obj2 block 3 3.6 0.25 0.85 EDGE EDGE units box
region obj3 sphere 4.3 0.5 0 0.25 units box
create_atoms 2 region obj1
create_atoms 2 region obj2
create_atoms 2 region obj3
group solids type 2
group tlsph type 2
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# DISCRETIZATION PARAMETERS
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variable h equal 2.5*${l0} # SPH kernel diameter
variable vol_one equal ${l0}^2 # initial particle volume for 2d simulation
set group all diameter ${h}
set group all smd/contact/radius ${l0}
set group all volume ${vol_one}
set group all smd/mass/density ${rho_water}
set group solids smd/mass/density ${rho_obj}
variable contact_scale equal 1.5 # scale factor to increase contact gap between bodies
variable skin equal ${h} # Verlet list range
neighbor ${skin} bin
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# DEFINE BOUNDARY CONDITIONS
#
# note that the the particles constituting the container are simply not integrated in time,
# thus these particles never move. This is equivalent to a fixed displacement boundary condition.
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fix gfix all gravity -9.81 vector 0 1 0 # add gravity
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# INTERACTION PHYSICS / MATERIAL MODEL
# 3 different pair styles are used:
# - updated Lagrangian SPH for water
# - total Lagrangian SPH for solid objects
# - a repulsive Hertzian potential for contact forces between different physical bodies
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pair_style hybrid/overlay smd/ulsph *DENSITY_CONTINUITY *VELOCITY_GRADIENT *NO_GRADIENT_CORRECTION &
smd/tlsph smd/hertz ${contact_scale}
pair_coeff 1 1 smd/ulsph *COMMON ${rho_water} ${c0} ${q1} ${Cp} 0 &
*EOS_TAIT 7.0 &
*END
pair_coeff 2 2 smd/tlsph *COMMON ${rho_obj} ${E} ${nu} ${q1} ${q2} ${Hg} ${Cp} &
*STRENGTH_LINEAR_PLASTIC ${sigma_yield} ${hardening_parameter} &
*EOS_LINEAR &
*END
pair_coeff 3 3 none
pair_coeff 1 2 smd/hertz ${contact_stiffness}
pair_coeff 1 3 smd/hertz ${contact_stiffness}
pair_coeff 2 3 smd/hertz ${contact_stiffness}
pair_coeff 2 2 smd/hertz ${contact_stiffness}
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# TIME INTEGRATION
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fix dtfix tlsph smd/adjust_dt 0.1 # dynamically adjust time increment every step
fix integration_fix_water water smd/integrate_ulsph adjust_radius 1.01 10 15
fix integration_fix_solids solids smd/integrate_tlsph
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# SPECIFY TRAJECTORY OUTPUT
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compute eint all smd/internal_energy
compute contact_radius all smd/contact_radius
compute S solids smd/tlsph_stress
compute nn water smd/ulsph_num_neighs
compute epl solids smd/plastic_strain
compute vol all smd/volume
compute rho all smd/rho
dump dump_id all custom 100 dump.LAMMPS id type x y &
fx fy vx vy c_eint c_contact_radius mol &
c_S[1] c_S[2] c_S[4] mass radius c_epl c_vol c_rho c_nn proc
dump_modify dump_id first yes
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# STATUS OUTPUT
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compute alleint all reduce sum c_eint
variable etot equal pe+ke+c_alleint+f_gfix # total energy of the system
thermo 100
thermo_style custom step ke pe v_etot c_alleint f_dtfix dt
thermo_modify lost ignore
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# RUN SIMULATION
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fix balance_fix all balance 1000 0.9 rcb # load balancing for MPI
run 40000
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