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Diffusion lammps (efficient_neuronet) Browse

lammps/src/GPU/Install.sh
7875009218a7efficient_neuronet

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Install.sh
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# Install/unInstall package files in LAMMPS
# mode = 0/1/2 for uninstall/install/update
mode=$1
# enforce using portable C locale
LC_ALL=C
export LC_ALL
# arg1 = file, arg2 = file it depends on
action () {
if (test $mode = 0) then
rm -f ../$1
elif (! cmp -s $1 ../$1) then
if (test -z "$2" || test -e ../$2) then
cp $1 ..
if (test $mode = 2) then
echo " updating src/$1"
fi
fi
elif (test -n "$2") then
if (test ! -e ../$2) then
rm -f ../$1
fi
fi
}
# list of files with optional dependcies
action fix_gpu.cpp
action fix_gpu.h
action gpu_extra.h
action pair_beck_gpu.cpp
action pair_beck_gpu.h
action pair_born_coul_long_gpu.cpp pair_born_coul_long.cpp
action pair_born_coul_long_gpu.h pair_born_coul_long.cpp
action pair_born_coul_wolf_gpu.cpp
action pair_born_coul_wolf_gpu.h
action pair_born_gpu.cpp
action pair_born_gpu.h
action pair_buck_coul_cut_gpu.cpp pair_buck_coul_cut.cpp
action pair_buck_coul_cut_gpu.h pair_buck_coul_cut.cpp
action pair_buck_coul_long_gpu.cpp pair_buck_coul_long.cpp
action pair_buck_coul_long_gpu.h pair_buck_coul_long.cpp
action pair_buck_gpu.cpp pair_buck.cpp
action pair_buck_gpu.h pair_buck.cpp
action pair_colloid_gpu.cpp pair_colloid.cpp
action pair_colloid_gpu.h pair_colloid.cpp
action pair_coul_cut_gpu.cpp
action pair_coul_cut_gpu.h
action pair_coul_debye_gpu.cpp
action pair_coul_debye_gpu.h
action pair_coul_dsf_gpu.cpp
action pair_coul_dsf_gpu.h
action pair_coul_long_gpu.cpp pair_coul_long.cpp
action pair_coul_long_gpu.h pair_coul_long.cpp
action pair_dpd_gpu.cpp
action pair_dpd_gpu.h
action pair_dpd_tstat_gpu.cpp
action pair_dpd_tstat_gpu.h
action pair_lj_cut_dipole_cut_gpu.cpp pair_lj_cut_dipole_cut.cpp
action pair_lj_cut_dipole_cut_gpu.h pair_lj_cut_dipole_cut.cpp
action pair_lj_sf_dipole_sf_gpu.cpp pair_lj_sf_dipole_sf.cpp
action pair_lj_sf_dipole_sf_gpu.h pair_lj_sf_dipole_sf.cpp
action pair_eam_alloy_gpu.cpp pair_eam.cpp
action pair_eam_alloy_gpu.h pair_eam.cpp
action pair_eam_fs_gpu.cpp pair_eam.cpp
action pair_eam_fs_gpu.h pair_eam.cpp
action pair_eam_gpu.cpp pair_eam.cpp
action pair_eam_gpu.h pair_eam.cpp
action pair_gauss_gpu.cpp
action pair_gauss_gpu.h
action pair_gayberne_gpu.cpp pair_gayberne.cpp
action pair_gayberne_gpu.h pair_gayberne.cpp
action pair_lj96_cut_gpu.cpp
action pair_lj96_cut_gpu.h
action pair_lj_charmm_coul_long_gpu.cpp pair_lj_charmm_coul_long.cpp
action pair_lj_charmm_coul_long_gpu.h pair_lj_charmm_coul_long.cpp
action pair_lj_class2_coul_long_gpu.cpp pair_lj_class2_coul_long.cpp
action pair_lj_class2_coul_long_gpu.h pair_lj_class2_coul_long.cpp
action pair_lj_class2_gpu.cpp pair_lj_class2.cpp
action pair_lj_class2_gpu.h pair_lj_class2.cpp
action pair_lj_cubic_gpu.cpp
action pair_lj_cubic_gpu.h
action pair_lj_cut_coul_cut_gpu.cpp
action pair_lj_cut_coul_cut_gpu.h
action pair_lj_cut_coul_debye_gpu.cpp
action pair_lj_cut_coul_debye_gpu.h
action pair_lj_cut_coul_dsf_gpu.cpp
action pair_lj_cut_coul_dsf_gpu.h
action pair_lj_cut_coul_long_gpu.cpp pair_lj_cut_coul_long.cpp
action pair_lj_cut_coul_long_gpu.h pair_lj_cut_coul_long.cpp
action pair_lj_cut_coul_msm_gpu.cpp pair_lj_cut_coul_msm.cpp
action pair_lj_cut_coul_msm_gpu.h pair_lj_cut_coul_msm.h
action pair_lj_cut_gpu.cpp
action pair_lj_cut_gpu.h
action pair_lj_expand_gpu.cpp
action pair_lj_expand_gpu.h
action pair_lj_gromacs_gpu.cpp
action pair_lj_gromacs_gpu.h
action pair_lj_sdk_coul_long_gpu.cpp pair_lj_sdk_coul_long.cpp
action pair_lj_sdk_coul_long_gpu.h pair_lj_sdk_coul_long.cpp
action pair_lj_sdk_gpu.cpp pair_lj_sdk.cpp
action pair_lj_sdk_gpu.h pair_lj_sdk.cpp
action pair_mie_cut_gpu.cpp
action pair_mie_cut_gpu.h
action pair_morse_gpu.cpp
action pair_morse_gpu.h
action pair_resquared_gpu.cpp pair_resquared.cpp
action pair_resquared_gpu.h pair_resquared.cpp
action pair_soft_gpu.cpp
action pair_soft_gpu.h
action pair_sw_gpu.cpp pair_sw.cpp
action pair_sw_gpu.h pair_sw.h
action pair_table_gpu.cpp pair_table.cpp
action pair_table_gpu.h pair_table.cpp
action pair_tersoff_gpu.cpp pair_tersoff.cpp
action pair_tersoff_gpu.h pair_tersoff.cpp
action pair_tersoff_mod_gpu.cpp pair_tersoff_mod.cpp
action pair_tersoff_mod_gpu.h pair_tersoff_mod.cpp
action pair_tersoff_zbl_gpu.cpp pair_tersoff_zbl.cpp
action pair_tersoff_zbl_gpu.h pair_tersoff_zbl.cpp
action pair_yukawa_colloid_gpu.cpp pair_yukawa_colloid.cpp
action pair_yukawa_colloid_gpu.h pair_yukawa_colloid.cpp
action pair_yukawa_gpu.cpp pair_yukawa.cpp
action pair_yukawa_gpu.h pair_yukawa.cpp
action pair_zbl_gpu.cpp
action pair_zbl_gpu.h
action pppm_gpu.cpp pppm.cpp
action pppm_gpu.h pppm.cpp
# edit 2 Makefile.package files to include/exclude package info
if (test $1 = 1) then
if (test -e ../Makefile.package) then
sed -i -e 's/[^ \t]*gpu[^ \t]* //' ../Makefile.package
sed -i -e 's|^PKG_PATH =[ \t]*|&-L../../lib/gpu$(LIBOBJDIR) |' ../Makefile.package
sed -i -e 's|^PKG_LIB =[ \t]*|&-lgpu |' ../Makefile.package
sed -i -e 's|^PKG_SYSINC =[ \t]*|&$(gpu_SYSINC) |' ../Makefile.package
sed -i -e 's|^PKG_SYSLIB =[ \t]*|&$(gpu_SYSLIB) |' ../Makefile.package
sed -i -e 's|^PKG_SYSPATH =[ \t]*|&$(gpu_SYSPATH) |' ../Makefile.package
fi
if (test -e ../Makefile.package.settings) then
sed -i -e '/^include.*gpu.*$/d' ../Makefile.package.settings
# multiline form needed for BSD sed on Macs
sed -i -e '4 i \
include ..\/..\/lib\/gpu\/Makefile.lammps
' ../Makefile.package.settings
fi
elif (test $1 = 0) then
if (test -e ../Makefile.package) then
sed -i -e 's/[^ \t]*gpu[^ \t]* //' ../Makefile.package
fi
if (test -e ../Makefile.package.settings) then
sed -i -e '/^include.*gpu.*$/d' ../Makefile.package.settings
fi
fi
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