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lammps/src/USER-INTEL/TEST/README
fb4577b4e6e5efficient_neuronet

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# Benchmarks
#
# in.intel.lj - Atomic fluid (LJ Benchmark)
# in.intel.rhodo - Protein (Rhodopsin Benchmark)
# in.intel.lc - Liquid Crystal w/ Gay-Berne potential
# in.intel.sw - Silicon benchmark with Stillinger-Weber
# in.intel.tersoff - Silicon benchmark with Tersoff
# in.intel.water - Coarse-grain water benchmark using Stillinger-Weber
#
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# Expected Timesteps/second on E5-2697v3 with turbo on and HT enabled
#
# in.intel.lj - 131.943
# in.intel.rhodo - 8.661
# in.intel.lc - 14.015
# in.intel.sw - 103.53
# in.intel.tersoff - 55.525
# in.intel.water - 44.079
#
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# For Haswell and Broadwell architectures, depending on the compiler version,
# it may give better performance to compile for an AVX target (with -xAVX
# compiler option) instead of -xHost or -xCORE-AVX2 for some of the
# workloads due to inefficient code generation for gathers. Aside from
# Tersoff, this will not significantly impact performance because FMA
# sensitive routines will still use AVX2 (MKL and SVML detect the processor
# at runtime)
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# The default benchmark timesteps will run between 30s and 1 minute with
# the Intel package. You can specify a multiplier for all of the benchmarks
# to increase or decrease the runtime. Example commandline arguments:
#
# -v m 2 # Run for twice as long
# -v m 0.5 # Run for half as long
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# Example for running benchmarks:
# Number of physical cores per node not including hyperthreads
export LMP_CORES=28
# If hyperthreading is enabled, number of hyperthreads to use per core
# (2 for Xeon; 2 or 4 for Xeon Phi)
export OMP_NUM_THREADS=2
# Name of the LAMMPS binary
export LMP_BIN=../../lmp_intel_cpu
# LAMMPS root directory
export LMP_ROOT=../../../
source /opt/intel/parallel_studio_xe_2016.2.062/psxevars.sh
export I_MPI_PIN_DOMAIN=core
export I_MPI_FABRICS=shm # For single node
# Generate the restart file for use with liquid crystal benchmark
mpirun -np $LMP_CORES $LMP_BIN -in in.lc_generate_restart -log none
# Benchmark to run
export bench=in.intel.lj
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# To run without a optimization package
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mpirun -np $LMP_CORES $LMP_BIN -in $bench -log none
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# To run with USER-OMP package
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mpirun -np $LMP_CORES $LMP_BIN -in $bench -log none -pk omp 0 -sf omp
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# To run with USER-INTEL package and no coprocessor
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mpirun -np $LMP_CORES $LMP_BIN -in $bench -log none -pk intel 0 -sf intel
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# To run with USER-INTEL and automatic load balancing to 1 coprocessor
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mpirun -np $LMP_CORES $LMP_BIN -in $bench -log none -pk intel 1 -sf intel
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