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#section la plus generale
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Section MultiScale RealUnits

UNITCODE RealUnits
DIMENSION 1

###### constants ######
LET r0 = 1.23157195294235
LET NBATOMS = 1000
LET LMD = NBATOMS*r0
LET ELSIZE = 8.1*r0
LET NBEL = 300
LET LFE = ELSIZE*NBEL
LET bridgingSize = ELSIZE*10
LET rcut = 2.2*r0
LET WaveLength = 200

###### geometries ######
#MD geom
GEOMETRY mdGeom BALL CENTER 0 RADII 0 LMD+bridgingSize
#FE geom
GEOMETRY feGeom BALL CENTER 0 RADII LMD LMD+LFE
# coupling geom
GEOMETRY bridgeGeom BALL CENTER 0 RADII LMD LMD+bridgingSize-ELSIZE
# boundary geom
GEOMETRY boundGeom BALL CENTER 0 RADII LMD+bridgingSize-ELSIZE LMD+bridgingSize
#stimulation geom
GEOMETRY stimGeom BALL CENTER 0 RADII 0 LMD

###### model declaration ######
ELAST_CODE AKANTU fe 
MD_CODE MD1D md

###### couplings ######
COUPLING_CODE bdm md fe XIAO GEOMETRY bridgeGeom BOUNDARY boundGeom GRID_DIVISION 10 QUALITY 1e-3

###### stimulations ######
FILTER central_md GEOM INPUT md GEOMETRY stimGeom
STIMULATION impulse IMPULSE INPUT central_md LWAVE WaveLength*r0 DIRECTION 0 INTENSITY 1.1e-3 ONESHOT 0

###### dumpers ######
DUMPER dmd1d DUMPER1D INPUT md FREQ 100 PREFIX ./ FIELD position
DUMPER dfe1d DUMPER1D INPUT fe FREQ 100 PREFIX ./ FIELD position
DUMPER dparamd PARAVIEW INPUT md FREQ 100 PREFIX ./ DISP VEL FORCE
DUMPER dparafe PARAVIEW INPUT fe FREQ 100 PREFIX ./ DISP VEL FORCE


endSection

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#MD section
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Section MD1D:md RealUnits
RCUT rcut
R0 r0
MASS 39.95
TIMESTEP 10
EPSILON 1.6567944e-21/6.94769e-21
SIGMA 1.1
DOMAIN_GEOMETRY mdGeom
endSection


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#FE section
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Section AKANTU:fe RealUnits
DOMAIN_GEOMETRY feGeom
TIMESTEP 10
ELEM_SIZE ELSIZE
MASS 39.95
R0 r0
RCUT rcut
EPSILON 1.6567944e-21/6.94769e-21
SIGMA 1.1
endSection

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